化学分子轨道计算软件是为广大化学专业的从事人员打造的实用软件,能够帮助用户快速分析出化学分子的运动轨迹。支持ADF、GAMESS(US)、GAMESS-UK,Gaussian和PC-GAMESS的输出,帮助用户提取和计算SCF循环过程、结构优化、UV-Vis/IR/Raman光谱、能级、MO贡献等有用的信息,是相关用户必备的化学分子轨道计算工具。
化学分子轨道计算工具(GaussSum)能够从ADF、GAMESS(US),GAMESS-UK、Gaussian和PC-GAMESS中提取出有用的信息,并进行结构的优化,满足用户的各种分子轨道计算需求。
【基本介绍】
1、显示包含某一关键词的所有行。
2、跟踪SCF收敛过程。
3、跟踪结构优化过程。
4、提取分子轨道信息,包括原子对分子轨道的贡献。
5、绘制态密度和部分态密度谱图。
6、绘制晶体轨道重叠布居(COOP)谱图,可以给出成键或反键信息。
7、提取UV-Vis跃迁的信息,包括原子电荷密度的变化。
8、绘制UV-Vis谱图和圆二色谱图。
9、提取IR/Raman振动信息。
10、绘制IR/Raman谱图,可加入换算因子。
【使用方法】
1,用实验室现成的GaussSum做DOS图时,发现log文件过大分析不了,下载到最新版本的问题就解决了。
2,经常出现cclib has problems parsing ***.log问题,检查自己的log文件是否完整。
3,关于做PDOS(重点哈),做单点能计算时必须要有pop=full iop(3/33=1,3/36=-1),关键字,这在GaussSum帮助文件和例子里面写得很详细。至于做PDOS的时候,需要有group.txt文件,选择做atoms时,具体的两个要求是每个原子要列出以及所列原子不能重复,这里我还得补充一点group.txt格式,
atoms
part1(你所想要分析的某个分子部分)
1-5,8-20,30(该部分原子序号)
part2
6-7,21-29,31-33(注意了,直接保存就可以,下面不能有空行,我被这个给整惨了)
在选择用orbitals时,大致一样,唯一不同就是不必列出所有的轨道。
4,就以上例子分析,我要的结果是part1和part2的PDOS,但GaussSum做出来的part1和part2的图的结果是part1和total(图上显示的是part2,经过数据对比很明显就是total)或者part2和total(同理),估计是我下载的软件bug,但可以从它产生的DOS Spectrum.txt文件(里面有你想要的part1,part2,total)提取数据在origin里面作图,结果就很好了。
5.在做COOP时,和做PDOS一个样。关于做其他图,遇到的问题就没什么了,只要你的log文件没错,基本就okay!
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